La Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos (siglas: FCB-UNMSM) es una de las veinte facultades que conforman dicha universidad. La facultad en la actualidad, dentro de la organización de la universidad, forma parte del área de Ciencias Básicas y cuenta con las escuelas profesionales de Ciencias Biológicas, de Genética y Biotecnología y de Microbiología y Parasitología, que brindan tanto estudios de pregrado como de posgrado. El pabellón principal de la facultad se ubica dentro de la Ciudad Universitaria de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, en Lima, Perú.

Las primeras cátedras de estudios de biología y ciencias naturales en la Universidad de San Marcos, acontecidas en el siglo siglo XVIII, son el origen directo de los estudios universitarios de estas áreas en el Perú. Estas se impartieron inicialmente tanto en el Real Convictorio de San Carlos como, posteriormente, en el Colegio de Medicina de San Fernando.^[1]​ Su enseñanza al interior de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos se inició oficialmente en 1862 con la creación de la Facultad de Matemáticas y Ciencias Naturales;^[2]​ así, su primer decano fue el naturalista italiano Antonio Raimondi. En 1876, pasó a denominarse Facultad de Ciencias,^[2]​ periodo en el cual la enseñanza de cátedras como la de zoología se moderniza, a la vez que la impartición de sus clases se llevaba a cabo en el entonces recientemente creado Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos.^[3]​ Hacia 1943 se crearon las secciones de ciencias físicas, ciencias matemáticas y ciencias biológicas,^[4]​ mientras que en 1947 la ley 10554 instauró la creación del Instituto de Ciencias Biológicas.^[5]​ Finalmente, la hoy vigente Facultad de Ciencias Biológicas, ubicada en la ciudad universitaria, fue creada en septiembre de 1984. Las actuales tres escuelas profesionales fueron establecidas en 2003 tras la inclusión de las escuelas de Microbiología y Parasitología, y Genética y Biotecnología.^[5]​

La Facultad de Ciencias Biológicas acogió en sus aulas a estudiantes y catedráticos que han destacado como científicos y docentes, entre los que se puede distinguir al biólogo y naturalista italiano Antonio Raimondi, quien fue además el primer decano de la facultad; el químico y botánico alemán Augusto Weberbauer; el científico naturalista peruano José Sebastián Barranca; y los esposos zoólogos alemanes Hans-Wilhelm Koepcke y Maria Koepcke; la botánica peruana Blanca León; entre muchos otros.^[6]​^[7]​